1 产品基本信息
产品名称:SatGreen qPCR Master Mix for HRM (2×)
产品编号:MF1844
2 规格或纯度
20 μL×100 T, 20 μL×500 T
组分 | 20 μL × 100 T | 20 μL × 500 T |
A. 2× SatGreen Master Mix for HRM | 1 mL | 5×1 mL |
B. 10× ROX Reference Dye(ROX 参比染料) | 0.2 mL | 1 mL |
注:组分 A 包含 SatGreen 染料、dNTP(脱氧核苷三磷酸)、PCR buffer(含 Tris 和 MgCl₂)、热启动 Taq 聚合酶。
3 产品介绍
产品简介:
本产品是一款适用于实时荧光定量 PCR(qPCR)和高分辨率熔解曲线(HRM)分析的专业试剂。其核心成分 SatGreen 是专为 qPCR 和 HRM 分析设计的新型双链 DNA(dsDNA)“饱和染料”,通过 “按需求释放” 机制选择性结合双链 DNA,能极大降低对 PCR 扩增的抑制作用,使双链 PCR 产物结合量达到饱和,且不会出现 SYBR Green 的染料重排问题,可精准区分扩增产物间单个碱基的差异。
产品用途广泛,可用于已知单核苷酸多态性(SNP)分析、未知突变基因扫描等;此外,产品中含 ROX Reference Dye,能消除信号本底,校正孔间荧光信号误差,方便用户根据不同型号荧光定量 PCR 仪选择对应浓度使用。
产品特点:
l高灵敏度:可精准探测 DNA 序列的细微差异,能识别单碱基变化,适配 HRM 分析对分辨率的高要求。
l低 PCR 抑制:对 PCR 扩增反应的抑制作用小,抑制效果远小于 SYBR Green I,保障扩增效率。
l高安全性:几乎不可穿透完整的细胞膜,无致突变性,生物安全性优于 SYBR Green I。
l兼容性好:与 SYBR Green I 光谱相似,可直接替代使用,无需更换仪器或更改实验步骤,降低方法迁移成本。
适用范围:
l实时荧光定量 PCR 实验
l高分辨率熔解曲线(HRM)分析
产品参数:
l结合 DNA 时:吸收波长(λabs)/ 发射波长(λem)= 500 / 530 nm
l未结合 DNA 时:吸收波长(λabs)= 471 nm
4 储存与运输
储存条件:-20℃避光保存,避免强光照射
运输条件:冰袋运输
5 使用方法(仅供参考)
在PCR 管中制备反应液(置于冰上进行配制)。
反应组分 | 20 μL 反应体系用量 | 终浓度 |
2× SatGreen Master Mix for HRM | 10 μL | 1× |
正向引物(10 μM)(见注 1) | 1 μL | 0.25 μM |
反向引物(10 μM)(见注 1) | 1 μL | 0.25 μM |
模板(见注2) | - | -ng |
10× ROX Reference Dye(见注3) | - | - |
RNase-Free ddH₂O | up to 20 μL | - |
注:
(1) 引物终浓度可根据情况在0.2~0.5 μM 间调整,通常为0.3 μM;
(2) 由于HRM 具有很高的灵敏性,尽量保持不同样本之间有相同的模板量(1-50 ng 基因组DNA 或1-50 pg 微生物DNA),同时使所有样本的Ct 值都低于30(21-25 较佳),样本之间的Ct 值差异不应超过3。
(3) 几种常见仪器的匹配ROX Reference Dye 浓度见下表:
仪器型号 | 推荐 ROX 使用浓度 | 终浓度 |
ABI 7900 HT | High ROX 1×(终浓度) | 1×(示例:2 μL ROX/20 μL 体系,5 μL ROX/50 μL 体系) |
ABI 7500 Fast | Low ROX 0.05~0.1×(终浓度) | 0.1×(示例:按 1︰10 稀释 10× ROX ; 2 μL ROX/20 μL 体系,5 μL ROX/50 μL 体系) |
Roche LightCycler96/ Roche LightCycler 480/ Qiagen Roter Gene | No ROX | 无需添加 |
设置反应程序,将反应液放入仪器,运行程序扩增。
l两步法
程序阶段 | 温度 | 时间 | 循环次数 | 荧光信号采集 |
预变性 | 95℃ | 120 sec | 1 | 否 |
变性 | 95℃ | 10 sec | 35 | 否 |
退火 & 延伸 | 60℃ | 30 sec | 35 | 是 |
熔解曲线分析(见注2) | ||||
l三步法
程序阶段 | 温度 | 时间 | 循环次数 | 荧光信号采集 |
预变性 | 95℃ | 120 sec | 1 | 否 |
变性 | 95℃ | 10 sec | 35 | 否 |
退火 | 60℃ | 15 sec | 35 | 否 |
延伸 | 72℃ | 30 sec | 35 | 是 |
熔解曲线分析(见注2) | ||||
注:
(1) 两步法适用于大多数引物Tm 为60 ℃的扩增;
(2) 三步法适用于退火温度低于扩增温度的扩增。如扩增片段引物较长,易引发非特异性扩增, 可提高延伸温度来降低这种情况。
(3) 在熔解曲线分析时,一般设置为0.02~0.1℃收集一次荧光。
(4) 先使用60℃30 sec 进行扩增,如出现非特异性扩增,可尝试在60-66℃范围内优化,提 高反应特异性。
(5) 进行初次熔解曲线分析前,需确定每组PCR 产物的Tm 值。进行熔解曲线分析时,熔 解曲线设置的温度范围应从65°C 到95°C,涵盖前期确定Tm 值整个范围。确定熔解温 度Tm 后,在后续熔解曲线分析实验中,可以设置熔解程序的最高熔解温度比所有PCR 产物的最高熔解温度高5°C,最高熔解温度比所有PCR 产物的最低熔解温度低5°C,这 样可以减少HRM 分析所需的时间。
6 注意事项
l本产品含荧光染料,荧光染料对光敏感,保存产品或配制 PCR 反应液时需严格避免强光照射,防止染料降解影响信号强度。
l本产品在 - 20℃不会冷冻,若运输或储存过程中意外冻上,需置于室温自然融化,融化后轻轻涡旋混匀,禁止剧烈振荡(避免酶活性降低),后续所有实验步骤需在冰上操作,防止试剂变质。
l配制反应体系时,需轻轻颠倒混匀各组分,禁止使用振荡器,尽量避免产生泡沫;泡沫会导致 PCR 管内体积不均、荧光信号采集异常,混匀后需瞬时离心,使管壁残留液体集中到管底。
l引物纯度直接影响反应特异性,低纯度引物易产生非特异性扩增产物,干扰 HRM 分析,建议使用 PAGE 级别及以上纯化的引物,使用前需通过电泳或分光光度计验证纯度。
l本产品仅限于科研用途,不得用于临床诊断、食品检测等非科研领域,且不得存放于普通住宅内,需存放在实验室专用试剂储存区(避光、-20℃条件)。
l为保障实验人员安全与健康,操作过程中需遵循所在实验室的常规安全规范,如佩戴一次性手套、护目镜,避免试剂接触皮肤与黏膜;若不慎接触,需立即用大量清水冲洗,必要时就医。
对于单核苷酸多态性基因分型实验,每种可能的基因型(野生型、杂合子、变异型) 至少需要一个已知基因型的基因组DNA 对照。
所有检测实验中都应包括一个无模板对照(NTC),可检测潜在的污染。
核心要点是 “短产物 + SNP 位点居中”:
l产物长度:较短的 PCR 产物可提高 HRM 分辨率,设计时尽量使产物长度在 80~300 bp 之间;若用于 SNP 分析,建议产物长度为 80~120 bp,单个碱基变化对短产物熔解行为的影响更显著,分辨率更高。
lSNP 位点位置:SNP 位点需尽量处在 PCR 产物序列的中间位置,避免位点靠近两端导致熔解信号差异不明显,影响分型准确性。
l非特异性控制:若引物较长易引发非特异性扩增,可通过提高延伸温度减少非特异性产物,避免其干扰 HRM 分析。
可以。HRM 具有很高的灵敏性,在条件允许的情况下可使用50 μL 反应体系,大的反应 体系可提高反应重复性,减少实验误差对熔解曲线的负面影响。
建议对所有用于 HRM 分析的样品使用相同的基因组 DNA 纯化方法,避免由于不同 提取方法中使用的洗脱缓冲液的不同组成而引入差异。
在 20 μL 反应体系中,基因组 DNA 模板量一般需小于 100 ng;模板纯度需满足 OD₂₆₀/OD₂₈₀在 1.6~2.0 之间,OD₂₆₀/OD₂₃₀在 1.5~2.0 之间。
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